红河州妇幼保健院是一所州卫生健康委下属财政全额拨款公益一类医疗卫生副处级事业单位，位于州府驻地蒙自市朝阳路中段，始建于1952年，至今已有68年建院史。1982年独立建站，1995年更名为红河州妇幼保健院。2003年2月，随州政府回迁蒙自，2004年4月由上海儿童基金会资助250万元的红河州上海妇幼保健中心建成投入使用。2016年11月，加挂“红河州妇女儿童医院”，实行两块牌子、一套人马。现有编制数180人，在职职工545人，其中，在编在职143人、在职外聘人员421人，在编在职人员中专技人员117人，占95%（其中，正高3人，占3%；副高31人，占25%；中职51人，占41%；初职32人，占26%）。老院区现有业务用房面积10222.71平方米，床位100张（实际开放137张）。在建的妇女儿童医院建筑面积115800平方米，设计床位500张，投资估算70000万元。预计2021年底建成投入使用，其中，妇幼保健综合楼于2020年11月建成投入使用，实现儿科整体搬迁试运营。
承担着全州妇幼卫生技术指导、妇幼健康服务管理和妇女儿童相关疾病的临床诊疗、危急重症、疑难病和突发公共卫生事件的医疗救治，以及县市级妇幼机构等级评审等工作职责和任务。围绕重点领域开展保健与临床相结合的妇幼卫生工作，加强与国内先进医疗资源输出医院和各级妇幼机构的合作与交流，打通妇女儿童健康的绿色生命通道，为政府决策提供科学依据，切实保障人民群众健康权益。通过不断强化孕产妇及儿童的健康管理，每年都控制在省级指标范围内且逐年在下降。2019年孕产妇死亡率、5岁以下儿童死亡率、婴儿死亡率分别控制在12.12/10万、7.9‰、4.87‰范围内，住院分娩活产数3247人，分娩量全州名列前茅；开展基层辖区公共卫生业务督导8次，举办培训班13期，培训2536人次。门诊诊治患者26.92万人次，同比增长16.02%；收治住院患者7134人次，同比增长23.30%；平均住院日4.8天，床位使用率94%；医疗业务收入同比增长33.50%；DRGS总量为6722.27，CMI值为0.9457。
设置了孕产保健部（下设孕产群体保健科、医学遗传与产前筛查科、孕期保健科、产科、产后保健科、心理卫生科）；妇女保健部（下设妇科、妇女保健生殖内分泌科、妇女群体保健与避孕药具管理科）；儿童保健部（下设儿童保健中心：儿童群体保健科、儿童生长发育及营养与喂养科、儿童心理卫生科、儿童康复科，儿童诊疗中心：儿童消化血液内分泌科、儿童呼吸科、儿科综合门诊、儿童重症医学科，新生儿诊疗中心：新生儿科、新生儿保健与遗传代谢性疾病科，小儿外科、儿童眼耳鼻喉保健科、儿童口腔保健科、中医儿科直属儿童保健部）；临床医技中心设外科中心（下设小儿外科、肛肠科)、临床检验中心、超声医学中心（下设妇产超声科、心脏超声科、小儿超声科）、放射医学中心、治未病中心（下设中医儿科、中医妇科、产后中医康复科、中医体检亚健康调理科）、健康管理中心（下设体检科、整合医学科）、手术麻醉一科、手术麻醉二科、口腔科、眼耳鼻喉科。行政职能科室设院办公室、党建办、工会、人事科、财务科、绩效办、医务部、护理部、教学科研部、宣传策划部、社工服务部、保健部、信息管理中心、医学装备部、药学部、医保与价格管理科、“三病”母婴阻断办公室、后勤服务中心、消防安全保卫科、总务科。
近年来，医院不断加大医疗设备投入，投资4855.74万元，先后购置了彩色多普勒超声诊断仪、西门子CT、钼靶、DR、宫腹腔镜、负压震动理疗仪、全自动毛细管电泳仪、肌肉功能分析仪、新生儿高频呼吸机、舌面脉信息采集体质辨识系统、孕期饮食营养分析与指导系统、血压脉波检查仪、中央监护系统、一体阴道镜、哺乳质量检测与促进指导系统、儿童饮食营养指导系统、尿腚甙定量检测分析系统、多普勒超声宫腔监测诊断系统、人乳成分分析系统、神经肌肉刺激治疗仪等妇产儿先进诊疗设备。目前，100万元以上设备有14台，10万元以上设备有65台，万元以上设备有243台。
与复旦大学附属妇产医院、复旦大学附属儿科医院、上海市儿童医院、青岛大学附属医院新生儿科、云南省第二人民医院、昆明市儿童医院等国内先进医疗资源输出医院保持着良好的合作关系，与全州13个县市妇幼保健院形成资源共享、分工协作的管理模式。构建以合作共建、跨区专科联盟、对口帮扶等不同方式，进一步提升了疑难症诊疗、示范推广适宜技术、培养人才及学科带头人等方面的能力。培养了生殖遗传内分泌，儿童重症医学、呼吸、消化、血液内分泌，妇科超声、心脏超声、小儿超声等一批在州内有影响力的二级学科带头人。率先在州内创立了儿童外科、儿童麻醉科，率先开展了年龄最小的新生儿手术麻醉，成功救治了“出生2天，体重为1630g的“自发性肠穿孔”患儿，填补了州内新生儿手术麻醉的空白。独立开展了州内医疗机构开展为数不多的新生儿脐动静脉置管术、新生儿胃肠穿孔修补术、新生儿肠切除肠吻合肠造瘘术、新生儿肛门成形术等新生儿外科手术和新生儿脑电监测技术。新技术新项目的开展，不断提升了医院的医疗保健服务能力。
2019年1月，成功创建三级甲等妇幼保健院，是国家级“爱婴医院”，第一批国家分娩镇痛试点医院，云南省中医药大学教学医院，红河卫生职业学院实习医院，州级危重孕产妇和危重新生儿救治中心，州级产前诊断中心。医院先后荣获国家卫生计生系统先进集体、全国三八红旗集体、云南省卫生系统先进集体、云南省妇幼卫生先进单位、云南省文明妇幼保健单位、创先争优省级示范单位、云南省实施妇女儿童规划先进集体、云南省五一巾帼标兵岗、云南省工人先锋号、红河州防治艾滋病人民战争先进集体、红河州红十字会先进单位、红河州民族团结示范医院、质量诚信示范单位、红河州优秀青年志愿服务团体、“红河好人”红河州妇幼保健院驰援湖北医务人员集体。